eu-LISA, het Europees Agentschap voor het operationele beheer van grootschalige IT-systemen is in december 2012 van start gegaan. Het staat in voor het operationeel beheer van SIS, VIS en Eurodac. Het Agentschap ontwikkelt momenteel ook aanvullende IT-systemen om het grensbeheer en de interne veiligheid in heel Europa te verbeteren. De belangrijkste taak is ervoor te zorgen dat deze systemen 24 uur per dag en 7 dagen per week operationeel zijn.