eu-LISA, die EU-Agentur für das Betriebsmanagement von IT-Großsystemen, nahm ihre Arbeit im Dezember 2012 auf. Sie ist für das Betriebsmanagement des SIS, des VIS und von Eurodac zuständig. Zusätzlich entwickelt die Agentur derzeit weitere IT-Systeme für ein besseres Grenzmanagement und mehr innere Sicherheit europaweit. Ihre Hauptaufgabe besteht darin, zu gewährleisten, dass diese Systeme rund um die Uhr funktionieren.