eu-LISA și-a început activitatea în decembrie 2012. Agenția asigură gestionarea operațională a sistemelor SIS, VIS și Eurodac. În prezent, ea dezvoltă și sisteme informatice suplimentare pentru a îmbunătăți gestionarea frontierelor și securitatea internă în întreaga Europă. Principala sa sarcină operațională este aceea de a asigura funcționarea non-stop a acestor sisteme.